软著代理服务费的收取方式可以根据代理机构的规定而有所不同。

一般来说，软著代理服务费可以采取以下几种方式进行收取： 1. 固定费用：代理机构会根据软著申请的复杂程度、工作量和服务内容等因素，制定一个固定的服务费用。

客户在委托代理机构进行软著申请时，需要按照约定的金额支付服务费用。

2. 按阶段收费：软著申请过程通常分为准备阶段、申请阶段和审查阶段等多个阶段。

代理机构可以根据每个阶段的工作量和服务内容，分阶段收取服务费用。

客户在每个阶段完成后支付相应的费用。

3. 按成功收费：有些代理机构会采取按照软著申请成功与否来收取服务费用的方式。

如果软著申请成功，客户需要支付一定比例的成功费用；如果软著申请失败，客户则不需要支付或只需支付部分费用。

无论采取何种收费方式，代理机构通常会在与客户签订代理合同时明确费用的收取方式和标准，并在服务过程中提供相应的费用清单和发票。

客户在选择代理机构时应仔细了解代理机构的收费方式，并与代理机构协商确定最合适的收费方式。