企业申请软件著作权需要准备的主要材料如下：

1. 软件源代码：软件源代码是软件开发过程中生成的核心代码，主要表现为程序员编写的程序语言源代码文件。

2. 软件设计文档/用户操作手册：软件设计文档是描述软件系统设计的技术文件。企业应准备完整的设计文档/用户操作手册。

3.申请表：软件著作权申请表是申请人向软件著作权登记机构提交的正式申请文件，主要包含软件名称、著作权登记人及其身份信息、软件类型等内容。

另外，申请软件著作权还应注意以下几点：

1.材料及时更新：申请人应该及时更新软件源代码、设计文档。

2.保密原则：申请软件著作权的企业应该遵守保密原则，防止泄露其商业机密。

3.权益保护：成功获得软件著作权之后，企业应该加强对软件版权的维护，加强对版权的保护，避免侵权行为。

企业申请软件著作权有以下几个重要的原因：

1.确保知识产权的合法性：成功获得软件著作权之后，企业可以证明其软件拥有合法的知识产权，防止他人对该软件的侵权行为。

2.增强竞争力：在软件市场上，获得软件著作权可以让企业拥有独特的优势，有利于企业树立品牌形象、提高市场竞争力。

3.增加商业价值：获得软件著作权之后，企业可以将软件著作权转让或授权给其他企业，增加软件的商业价值，实现更多的商业机会和收益。

4.参与国际市场竞争：随着经济全球化的加剧，国际市场竞争日益激烈，软件著作权成为国际贸易中重要的交易标的。获得软件著作权可以让企业在国际市场上更加自信地参与竞争。

5.促进技术创新：获得软件著作权可以鼓励企业创新，提高技术水平，从而促进行业技术创新，推动经济发展。

  总之，企业申请软件著作权可以帮助企业保护知识产权，增强竞争力，提高商业价值，参与国际市场竞争，促进技术创新。